O Museu Municipal de Vila Franca de Xira possui um acervo constituído por bens museológicos de diversas áreas disciplinares, nomeadamente Arqueologia, Artes Plásticas (Pintura, Desenho, Escultura, Gravura), Artes Gráficas, Epigrafia, Etnografia, Fotografia (espólio de Terence Spencer, Carlos Tomé, entre outros) e Numismática, assim como por um importante espólio documental.
No acervo contam-se ainda as coleções de Arte Sacra (séculos XV ao XVIII) e Antoniana, esta reunida pelo Dr. Vidal Baptista fundador do Museu, o espólio de Júlio Goes que engloba trabalhos do artista e documentação e o espólio do Padre Dr. Vasco Moniz.
Na história da incorporação de bens museológicos no acervo do Museu Municipal de Vila Franca de Xira existiram dois momentos distintos e perfeitamente identificáveis. O primeiro, balizado entre 1951-1971, corresponde ao período de fundação e afirmação da Biblioteca-Museu Dr. Vidal Baptista como projeto pessoal do seu fundador. O segundo, iniciado no pós 25 de abril de 1974, caracteriza-se por uma reinterpretação e maturação das propostas da Nova Museologia, sucedidas por uma progressiva autonomização conceptual a partir do final da década de 90 do século XX.
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          A calamidade das cheias de Lisboa A calamidade das cheias de Lisboa1967 
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          Aldeia de Avieiros, 1988 Aldeia de Avieiros, 19881988 
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          Anel Romano Anel RomanoSéc. II/III d.C. 
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          Ânfora vinária romana do tipo Lusitana 3 possivelmente fabricada no Vale do Tejo Ânfora vinária romana do tipo Lusitana 3 possivelmente fabricada no Vale do TejoSéc. IV d.C. (337-350 d.C) 
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          Apresentação do Calvário Apresentação do CalvárioSéc. XVI 
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          Árvores Árvores1955 
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          Azulejo Hispano-árabe Azulejo Hispano-árabeSéc. XVI 
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          Barco Suzana, rumo ao Cais Barco Suzana, rumo ao CaisDéc. 40 do Séc. XX 
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          Cabeça de cavalo Cabeça de cavalo1960 
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          Cabeça de touro sobre amarelo Cabeça de touro sobre amarelo1996 
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          Caixa de lentes de ensaio, proveniente do Oculista Nunes Caixa de lentes de ensaio, proveniente do Oculista NunesS.d. 
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          Campinos de sentinela na lezíria Campinos de sentinela na lezíriaS.d. 

